Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC6A9P48067 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms