Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFMP43652 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFMP43652 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFMP43652 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFMP43652 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFMP43652 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFMP43652 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFMP43652 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFMP43652 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms