Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MLH1P40692 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MLH1P40692 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MLH1P40692 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MLH1P40692 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLH1P40692 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLH1P40692 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLH1P40692 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MLH1P40692 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms