Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACTN2P35609 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms