Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COPB2P35606 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COPB2P35606 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPB2P35606 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPB2P35606 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPB2P35606 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms