Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.57■■■□□ 2.33
ABCC1P33527 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ABCC1P33527 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms