Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX2P32243 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX2P32243 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX2P32243 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OTX2P32243 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OTX2P32243 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTX2P32243 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTX2P32243 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTX2P32243 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms