Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF1P30408 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms