Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5DP30049 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms