Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2E2P29084 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms