Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAMP1P23763 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms