Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3BP20337 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms