Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNA2P20248 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms