Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TFE3P19532 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TFE3P19532 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFE3P19532 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFE3P19532 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFE3P19532 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFE3P19532 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFE3P19532 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TFE3P19532 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TFE3P19532 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TFE3P19532 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TFE3P19532 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TFE3P19532 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms