Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIG1P18858 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIG1P18858 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIG1P18858 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LIG1P18858 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms