Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGB4P16144 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGB4P16144 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms