Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME1P15531 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME1P15531 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME1P15531 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME1P15531 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NME1P15531 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NME1P15531 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms