Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CD46P15529 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CD46P15529 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CD46P15529 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD46P15529 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD46P15529 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms