Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BRAFP15056 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BRAFP15056 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRAFP15056 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms