Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRG2P13727 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRG2P13727 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRG2P13727 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRG2P13727 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRG2P13727 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRG2P13727 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRG2P13727 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRG2P13727 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms