Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GLI3P10071 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GLI3P10071 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI3P10071 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI3P10071 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI3P10071 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI3P10071 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GLI3P10071 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GLI3P10071 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GLI3P10071 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GLI3P10071 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms