Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PKHD1P08F94 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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PKHD1P08F94 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PKHD1P08F94 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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