Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOP08100 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RHOP08100 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RHOP08100 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RHOP08100 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RHOP08100 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RHOP08100 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RHOP08100 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms