Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC3P02656 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC3P02656 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC3P02656 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC3P02656 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC3P02656 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
APOC3P02656 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
APOC3P02656 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms