Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TOP3BO95985 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms