Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3JO75822 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3JO75822 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms