Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIA3O75145 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms