Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MITFO75030 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MITFO75030 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MITFO75030 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MITFO75030 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MITFO75030 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MITFO75030 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms