Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
KIAA0556O60303 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms