Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPAG9O60271 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPAG9O60271 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SPAG9O60271 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
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