Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.33■■□□□ 1
EXTL3O43909 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXTL3O43909 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXTL3O43909 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EXTL3O43909 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EXTL3O43909 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms