Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DENRO43583 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DENRO43583 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DENRO43583 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DENRO43583 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms