Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF3O43395 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms