Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SOCS1O15524 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms