Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IKBKBO14920 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IKBKBO14920 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms