Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms