Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EBAG9O00559 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms