Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLRMTO00411 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLRMTO00411 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms