Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIK3CDO00329 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms