Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms