Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B4E171 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4E171 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4E171 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4E171 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4E171 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B4E171 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B4E171 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
B4E171 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B4E171 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B4E171 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms