Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMX3A6NHT5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms