Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCP1A6NGW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCP1A6NGW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms