Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POTEB3A0JP26 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms