Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR5H1-202ENST00000641874 5999 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 YAP1-203ENST00000524575 1638 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CFAP57-201ENST00000372492 4244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL450992.1-201ENST00000432386 4109 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HAUS2-201ENST00000260372 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SNRPD2P1-201ENST00000489253 354 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SUMO2P17-201ENST00000504438 285 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC113143.2-201ENST00000603849 394 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC002094.4-201ENST00000613598 307 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 PARP9-201ENST00000360356 3198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC00210-201ENST00000431637 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ERCC6-208ENST00000515869 3439 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GBP5-201ENST00000370459 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RPL12P27-201ENST00000414870 496 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 LINC02024-202ENST00000493545 483 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
MKRN3Q13064 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
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