Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXO1Q12778 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms