Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
XIRP1Q702N8 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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