Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXA9P31269 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms