Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORD10-201ENST00000459579 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SL709P-201ENST00000478855 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LSP1P2-201ENST00000479042 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SL766P-201ENST00000494719 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC006978.1-201ENST00000496846 1234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IGHV3-25-201ENST00000518224 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MBP-228ENST00000527041 582 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RPAIN-214ENST00000574003 561 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF667-AS1-203ENST00000586822 468 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SL803P-201ENST00000607433 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AP001877.1-201ENST00000611253 484 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 Metazoa_SRP.151-201ENST00000616313 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC113385.3-201ENST00000621479 747 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL022326.2-201ENST00000623458 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CU638689.3-201ENST00000624266 1031 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC243547.3-202ENST00000625258 192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC163-207ENST00000629482 953 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ASH2L-207ENST00000521652 2433 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PGA4-201ENST00000378149 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-207ENST00000399597 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-208ENST00000399601 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-217ENST00000399641 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1C-218ENST00000399644 6511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GLS2-215ENST00000539272 2174 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF9-221ENST00000635967 2179 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RBBP8-204ENST00000399722 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OLMALINC-201ENST00000454935 2551 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SCMH1-209ENST00000397174 2977 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms