Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 RPL5P5-201ENST00000392009 893 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
GRIK4Q16099 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms